Eczacılar İçin Şirket Kurma Rehberi 2026

Halk sağlığının en önemli halkası olan eczaneler aynı zamanda çok yüksek bir günlük işlem hacmine ve karmaşık bir SGK faturalandırma sürecine sahiptir. İlaç Takip Sistemi (İTS) ile muhasebe kayıtlarınızın birebir uyuşmasını sağlamak ve yıl sonunda stok cezalarıyla karşılaşmamak için Ankara muhasebeci kadromuzun sağlık sektöründeki tecrübesinden faydalanabilirsiniz. Eczacılar için şirketleşme ve vergi süreçlerine yakından bakalım.

Eczacılık fakültesinden mezun olup kendi eczanenizi açmaya karar verdiğinizde, raflara dizeceğiniz ilaçlardan çok daha karmaşık bir sistemle karşılaşırsınız: Maliye ve SGK mevzuatı.

Bir eczane perakende satış yapan bir dükkan gibi görünse de arka planda Sağlık Bakanlığı, Sosyal Güvenlik Kurumu (SGK) ve Gelir İdaresi Başkanlığı’nın (GİB) anlık denetimi altındadır. Kutusu okutulan her ilacın kesilen her e-faturanın ve SGK’ya gönderilen her icmalin kuruşu kuruşuna tutması gerekir.

Eczaneler İçin Şirket Türü: Limited Kurabilir miyim?

Eczacılık sektöründe kanun çok nettir. Eczaneler sadece Şahıs İşletmesi (Gerçek Kişi Mükellefiyeti) olarak kurulabilir.

6197 sayılı Eczacılar ve Eczaneler Hakkında Kanun gereği;

• Bir eczane yalnızca diploması olan bir eczacı adına açılabilir.
• Eczacılar, eczaneleri için Limited (Ltd. Şti.) veya Anonim Şirket (A.Ş.) kuramazlar.
• Bir eczacı, birden fazla eczane açamaz veya başka bir eczaneye ortak olamaz.

Bu nedenle şirket kuruluşunuz şahıs işletmesi statüsünde yapılacak olup, Gelir Vergisi mükellefi olacaksınız. Geliriniz arttıkça, %15 ile başlayıp %40’a kadar uzanan artan oranlı vergi dilimlerine tabi olacaksınız. Bu durum eczanelerde Yasal Gider Yönetimini hayati bir konuya dönüştürür.

İTS (İlaç Takip Sistemi) ve Stok Yönetimi

Bir eczanenin muhasebesini standart bir market muhasebesinden ayıran en büyük özellik İTS‘dir.

Eczanenize giren her bir kutu ilaç üzerindeki karekod ile Sağlık Bakanlığı sistemine kaydedilir. İlacı hastaya sattığınızda bu ilaç İTS’den düşülür.

Mali Risk Nerede Başlar? Eğer eczane otomasyon programınız ile resmi muhasebe kayıtlarınız birbirini tutmazsa büyük bir kriz çıkar. Fiilen rafınızda olmayan ama sistemde görünen ilaçlar veya sistemde olmayan ama rafınızda duran ilaçlar yıl sonunda Envanter Uyuşmazlığı oluşturur. Bu durum maliyenin dikkatini çeker ve ağır vergi cezalarıyla sonuçlanabilir. Eczane muhasebesi, günlük işlenmesi ve anlık takip edilmesi gereken bir uzmanlık alanıdır.

SGK Faturalaşma Süreci ve E-Fatura Zorunluluğu

Eczanelerin cirosunun büyük bir kısmı SGK reçetelerinden gelir. Ay boyunca hastalarla yapılan işlemler Medula sistemine girilir ve ay sonunda SGK’ya toplu bir e-Fatura kesilir.

• E-Fatura Zorunluluğu: Eczaneler, SGK ile sözleşme yaptıkları andan itibaren E-Fatura mükellefi olmak zorundadırlar.
• Kesintiler ve Muhasebeleştirme: SGK size ödeme yaparken Muayene Ücreti, İskonto veya cezai kesintiler uygulayabilir. Hesabınıza yatan net para ile kestiğiniz brüt fatura arasındaki bu farkların, muhasebe kayıtlarına doğru gider/indirim kodlarıyla işlenmesi gerekir. Aksi takdirde tahsil etmediğiniz paranın vergisini ödersiniz.

KDV Oranlarındaki Karmaşa: %10 mu, %20 mi?

Eczaneler artık sadece ilaç değil dermokozmetik, gıda takviyesi, anne-bebek ürünleri ve medikal malzemeler de satmaktadır. Bu karma sepet KDV oranlarında ciddi bir takip gerektirir.

• İlaçlar ve Tıbbi Ürünler: Genellikle %10 KDV oranına tabidir.
• Kozmetik, Parfüm ve Çoğu Gıda Takviyesi: Lüks tüketim veya farklı kategoride sayıldığı için %20 KDV oranına tabidir.

Yazar kasadan fiş keserken veya e-Arşiv fatura düzenlerken, ürünün doğru KDV departmanından çıkışının yapılması zorunludur. Yanlış KDV oranından fiş kesmek, vergi ziyaı cezasına neden olur.

Eczane Açılış Maliyetleri ve Gider Yazılabilecek Kalemler

Bir eczane açmak devir hakkı, raflar, ışıklı tabelalar, ilaç dolapları ve bilgisayar sistemleri derken milyonlarca liralık bir yatırımdır.

Ödeyeceğiniz vergiyi yasal olarak düşürmek için bu harcamaları doğru yapılandırmalısınız:

• Demirbaşlar ve Amortisman: Yaptırdığınız özel tasarım eczane dolapları, soğutucular, yazar kasa POS cihazları ve bilgisayarlar tek seferde gider yazılamaz. Faydalı ömürlerine göre yıllara bölünerek (amortisman) vergiden düşülür.
• Kira Stopajı: Eczane dükkanınız kiraysa her ay brüt kiranız üzerinden %20 stopaj vergisi ödersiniz. Bu rakamı başlangıç maliyetlerinize mutlaka eklemelisiniz.
• Personel (Kalfa/Çırak) Giderleri: Eczanede çalışan eczane teknisyeni ve kalfaların maaşları ile SGK primleri en büyük aylık giderleriniz arasındadır. Bu personeller için devletin sağladığı SGK İstihdam Teşviklerinden yararlanmak, aylık prim yükünüzü ciddi oranda hafifletir.

Genç Eczacılar İçin Vergi Fırsatı (2026 Güncellemesi)

Eczacılık fakültesinden yeni mezun oldunuz 29 yaşını doldurmadınız ve ilk eczanenizi açıyorsunuz. Devlet size Genç Girişimci Desteği sunar:

• 3 Yıllık Vergi Muafiyeti: Açılıştan itibaren 3 yıl boyunca her yıl güncellenen kazanç limitine kadar olan kârınızdan Gelir Vergisi ödemezsiniz.
• Bağ-Kur Detayı: 2026 yılı itibarıyla Genç Girişimciler için Bağ-Kur prim desteği kaldırılmıştır. Yani vergi ödemeseniz de, eczaneyi açtığınız ilk aydan itibaren kendi Bağ-Kur (4B) priminizi cebinizden ödemek zorundasınız.

Sıkça Sorulan Sorular

Eczanemi devralırken ödediğim Hava Parası gider yazılır mı?

Eczane devirlerinde ruhsat devri için ödenen yüksek bedeller belgelendirildiği takdirde Gayrimaddi Hak olarak aktife alınır ve belirli bir amortisman süresi içinde giderleştirilebilir. Ancak bu işlem çok teknik bir vergi planlaması gerektirir.

Tarihi geçen ilaçları çöpe atıp vergiden düşebilir miyim?

Hayır, kendi başınıza atamazsınız. Son kullanma tarihi geçen ilaçların İTS’den düşülebilmesi ve zarar yazılarak vergiden indirilebilmesi için Sağlık Bakanlığı ve Çevre Bakanlığı mevzuatlarına uygun olarak İmha Tutanağı düzenlenmesi ve lisanslı imha tesislerine teslim edilmesi gerekir. Aksi takdirde o ilaçlar hala stoğunuzda ve kârınızda görünür.